Leg kedua diadakan di Stadion Batakan, Balikpapan, pada Minggu 19 Mei 2024 malam. Pertandingan ini diperkirakan akan berjalan sengit karena kedua tim berusaha keras untuk lolos ke final.
Namun, sebelum pertandingan dimulai, bus Madura United yang hendak masuk ke area stadion mendapat teror dari suporter Borneo FC yang melempari bus dengan telur.
“Tinggal beberapa meter dari gerbang Stadion Batakan, tiba-tiba kami dihadang puluhan suporter yang langsung melempar telur. Petugas keamanan masih berada di dalam pintu stadion,” kata Media Officer Madura United, Ferdiansyah Alifurrahman, Minggu 19 Mei 2024.
Teror tersebut mengejutkan skuad Madura United yang berada di dalam bus. Meski demikian, rombongan Madura United sampai di stadion dengan selamat.
